巴格达篇：
很快，几个月的时间过去了，塞特决定和慧彦一同前往中国以学习王道，临走的时候和薇达干了一架，打赢后她终于答应让塞特离去 → 经过沙漠后向东走，沿丝绸之路可到达另外一个沙漠城市--巴格达 → 在旅店打探情报后，可往军营找石国王子 → 等待一番（5分钟）后，得知只有找到暗黑修罗帖才能证明自己的实力（也可以在之前直接去北方山洞拿） → 很容易就得到了暗黑修罗帖，但王子竟然不相信，硬是找了几个大汉来测试塞特 → 战胜后，进入帐篷内再次和麦尔斯见面，慧彦提出前往唐军阵中请求退兵，但受到麦尔斯的阻拦，过程中赛特被麦尔斯用撒旦系的黑魔法击伤 → 醒来的时候塞特发现自己身处沙漠的绿洲，原来是慧彦抓了石国王子做人质以让大家逃脱 → 绿洲上出现了一个幻影石国，而石国王子也突然失踪，大家在右边的水井里发现了一条通道 → 穿越地下迷宫，在尽头处找到了石国王子，其后妖怪蜃楼王出现 → 解救王子后众人继续向中国边境前进，在怛罗斯遇到了黄雷和他的士兵们，原来他们正在此地埋伏，等待把前来的大食军队一举歼灭 → 刚打败了机关兽，大食和唐军的激战就发生了 → 战场上的形势几番变化，慧彦让赛特带石国王子往山上逃，自己则以一己之力试图阻止两军混战，但其后唐军大败，而慧彦为了掩护撤退中的唐军大破杀戒，最后英勇阵亡……
薇达找到了塞特一行人，并把他们带回波斯……当塞特再次醒来时，竟然发现一切发生了巨大的变化，五年的光景已经过去，薇达成了塞特的妻子，而塞特自己则做了当时波斯的最高执政官，就连蓝魔神和姆斯比尔这样的强者也对他俯首称臣 → 在大厅见到麦尔斯后，塞特迷迷糊糊地决定出兵攻打中国 → 大军在穿越怛罗斯时，慧彦的魂魄突然出现，使赛特突然觉悟，慧彦把他带往天山找一个重要的人 → 通往天山的路上，塞特受到了麦尔斯等人以友情、爱情甚至武力的诱惑与阻挠，但最终都不能动摇塞特的决心 → 在轩辕剑仙的帮助下，塞特收服了幕后黑手--蜃楼王，但他同时也了解到，如果不阻止前往破坏王道的麦尔斯，那么这五年的幻景将会是他们的未来 → 轩辕剑仙为塞特引见了慧彦的真身，唐朝的开国功臣--仙人李靖，以后李靖将会带领塞特前往充满神秘色彩的中国……
相关支线剧情和隐藏秘密：
1.某军营一军官说军刀被盗给你200 枚银币买来，出门听两小孩对话，得知刀藏在骆驼旁的草丛里，给军官可得到100 枚银币。（画面左边第二个帐幕内的兵器架上也可免费找到一把弯刀）
2.某帐幕前再遇大马士革拍卖女奴的人，会以3000枚银币收购你的中国剑，最好不要卖给他，以后此剑在长安可冶炼成名剑"鱼肠"。
3.天山密道密云处可找到"鬼云"一片。
中国篇：
按照李靖的提示在长安西市的南方找到白连仪 → 为了把慧彦的舍利子安置好，塞特准备先往少林寺一趟 → 在少林门口见到悟缘，他得知赛特的身份后，执意要塞特过木人巷进少林 → 木人巷有三条通道可走，分别可以得到不同的宝物，玩家可以随意选择 → 出巷后，悟缘安置好舍利子，就忙着去洛阳找黑坛教教徒黄八，塞特闲来无事，自然也跟着去了 → 在洛阳的怡春院（左下方的房子）里得到黄八去了长安西市的情报 → 回到长安西市的杜康居，得知发生了杀人事件，另外案犯黄八逃到了旧长安废墟 → 进入长安附近的汉安废墟，沿途注意收集硝石、硫磺、炭粉和竹筒四种物品，以后有用。一番搜索后找到黄八，干掉这个没良心的家伙后，回程途中碰上了王思月 → 回到长安，在老古的杂货店那里请他用硝石、硫磺、炭粉和竹筒制作出炸药，再回废墟把那个可疑的洞口轰开，里面竟然发现了康那里士和由人骨组成的反曼陀罗阵 → 悟缘的意志力薄弱，被康那里士变成了怪物，不过打败他后就可以恢复 → 王思月把大家带到了她的家，在那里见过了王善人和慧荣大师 → 一番剧情的交代后，晚上黄雷突然出现，在打败他的新型机关兽后，黄雷竟然炸毁了王善人的家，万幸的是王思月能够幸免 → 把王思月安置在白家后，老白答应带赛特去见皇上 → 第二天，在朱鹊门前的守卫口中得知皇帝去了骊山搞送别会 → 骊山的位置在长安东面，白大人进去后，塞特可以先四处走走 → 从卫兵左边的小路进去，在树林里遇见了黑坛教教主雨丹子（战斗中要小心他的毒攻击） → 摆平这东西后，塞特得到了唐王的接见，并认识了东瀛的林明 → 回白府，得知王思月被黑坛教抓走，塞特马上前往洛阳的黑坛教总坛救人 → 在总坛的塔门前遇大侠张客，他也会加入协助塞特 → 在塔的一楼找到齐圆珠、二楼找到太极图和天扇后就可以打开通往三楼的机关 → 四楼的开关要借助两个机关人来打开，而操纵他们的两张控尸符在解签架上，重复几次到签筒里抽签，然后到解签架解签即可得到 → 塔顶找到雨丹子和被控制的王思月，和王思月打不用浪费精力，死撑几回合后张客会叫狮子镇邪破妖法 → 打败雨丹子后，塞特把它也收进了炼妖壶 → 带王思月回白家后，和林明一起夜闯东平郡王府 → 通过传送点来到三楼，救出被石化的慧荣和张客，并且打败了再次出现的康那里士 → 继续搜索，找出了军令书和起兵计划书 → 通过黄雷（这坏蛋死得好冤枉，哈哈）的房间进入暗门 → 穿过密道来到王宫，再次见到了唐玄宗，虽然慧荣以死谏国，但情况竟变得不可收拾，最后连塞特也被撒旦化的麦尔斯所杀 → 几年后，四处流离的塞特灵魂遇到诗人李白 → 轩辕剑仙把塞特召唤回来，并帮他重新塑造了肉身，塞特身世的迷也在与剑仙和大天使米勒加的对话中得到解答 → 为了对付即将利用反曼陀罗阵破坏世界均衡的撒旦，得到轩辕剑相助的塞特齐集以前曾经并肩作战的同伴们，再次前往长安废墟并向撒旦发起了最后的决战，而这场惊天动地的激战将会影响整个世界的未来……
